吴四娘生于唐贞观二十三年，即公元649年农历七月十五日，出生地为江苏浮海白鹤村吴家庄。父亲吴竞，祖籍河南光州固始县善进乡，名锋，讳惠远，致仕后任唐仆射直笔，后因事弃官前往苏州城开设祖传药堂，铺名百福堂，人称百福先生。吴竞生五男一女，长发、次兴、三良、四媛（女）、五瑞、六斌。因吴媛居四，故称四娘。

据传，吴媛出生时，梅雨连天的七月却有众多蝴蝶翩翩起舞在百福堂周围，不久即降生了一个女婴，众人对这一好兆头十分重视，故给她取乳名小迪，绰号蝴蝶精。吴媛秀外慧中，对医学颇感兴趣，孜孜不倦，背诵医书，过目成诵。她重于实践，经常跟父亲上山采药，辨识各种青草秘方，积累丰富的医学知识。

唐高宗669年，吴竞长子吴发致仕后被授贺州节度使而迁往辽阳省。吴竞携其余子女入闽，经汀州，后居福州侯官县。吴家初至福州，吴媛芳容便传出百里方圆之外，时有一纨绔子弟仗财势前往求亲，吴竞不敢得罪这财主，违心收下财礼。十分反对这门亲事的吴四娘说不动父亲，便拒婚离家出走，化名云游江西庐山、浙江金华等地，先后拜昆仑大仙师，并到黎山老母学道，学成归来凭着精湛医术，针草治病，惠及穷苦百姓。公元671年，吴四娘经尤溪南下永福（今永泰县）梧桐至清源县（今仙游）古寨下来到兴角山下古峰亭，又称古峰庵。长年与庵内主人林阿治济世救灾民，百姓口碑载道。因吴四娘无论是在医术或道行上，都是林阿治无法比拟的，为了其前途，林阿治以“小庙住不了圣姑”和“释道不同家”为由，带着吴四娘上兴角山择凤凰朝天宝地结茅而居，修道行医，利民益世，为百姓所拥护和爱戴，威名远播。

唐武后永昌元年（公元689年），客居侯官的吴家得知吴媛消息后，思亲心切，便命次子吴兴（字起祖，号长官，行十三）偕胞弟吴良、吴瑞及从弟吴曦、吴璋等数十人自福州寻妹至莆田，分别定居华岩山和九华山等地。边打听胞妹吴四娘下落。一日得知其妹于仙游兴角山又得《灵宝毕法》真传，法力无边，泽施闽中方圆百里，便溯溪（今该溪因吴兴俗称延寿先生而得名延寿溪）寻源至仙游兴角山下的常太里余脉马院里攀上古峰山（亦称吴公山，莆仙方言谐音，至今上辈子老人在字面上亦写作吴公山），终于得见失散多年的胞妹。

兄妹相见，其乐融融。然而，当吴兴以父危母病的托词说动吴媛下山回家的善意谎言被揭穿时，兄妹二人已行至兴角山脉延至笔架山腰风巷下。十分体恤兴角山方圆百姓疾苦的吴媛，便拒绝胞兄的请求，就拿出采药时捡到的一块手帕给他，只见上面有“修道行善”四个墨字，告诉兄长，这是王母娘娘所赐，只要能将这块手帕上面的字迹洗掉，自己便跟着哥哥回家。吴兴当真把手帕丢在一个山涧开始搓洗。可是，尽管他用尽办法揉搓淘洗，手帕上的墨迹不但没有褪色，反而越来越清晰。最后，无法按约完成洗字的诺言，吴兴自知妹的道法非自己所能比，只好作罢。旋即随着妹妹在兴角山学法修行。至今，“洗字坑”古迹犹存，成了当地百姓传播吴妈民俗文化的一个重要佐证。

唐中宗神龙年间（公元705年-707年），吴媛助兄吴兴率乡民修筑杜塘长堤，捍潮为田。堤自溪白，经洞湖、后卓、漏头、泰叶庄，至沙塘坂，趋泄口，长12公里，以阻挡海潮侵袭，并引延寿溪水灌溉耕田。又建延寿陂以堰溪为利，修河道62道，北至漏头汇萩芦溪水，南至郊下汇木兰溪水，水沟纵横交错，既排洪，又有效地灌溉农田，形成延寿溪中下游流域主渠支流四面交汇的水利体系，受益范围达172村庄，良田18万亩，成就了杜塘之东、木兰之北的莆田北洋平原。

公元709年，时逢八月山洪暴发，滔天洪水自上游狂泻而下，延寿陂岌岌可危。乡民护堤抗洪。吴兴虽年事已高，但凭借丰富的治水经验和兴角山学道法力，以刀劈木为筏，拦护堤坝，以杉椿为基，聚沙石拦堵决口。吴四娘夜观星相，从兴角山下山赶来相助，焚香施法术，祈求河神保佑。时人还看到水中蛟龙挽起狂澜作怪，吴兴义薄云天地说：“何惧，吾当斩孽蛟！”毅然决然地投身狂浪中，并昂首喊道：“洪清则蛟死，洪赤则吾死，清赤混腾则人蛟俱毙矣。”

正当吴兴在水中与蛟龙博斗的生死关头，吴媛施法术用神针飞刺蛟龙眼珠，使蛟龙威风大减，但还与吴兴殊死搏斗，最后蛟龙被吴兴刀劈断头，其地方至今名为漏头。孽龙化为一缕青烟上天时，被吴媛收伏呈祥百姓，至今供奉在哆头昭惠庙内，与天妃同受世人祭祀。可吴兴也身受重伤而被洪水卷入深潭，不复上岸，至今该潭叫吴公潭。其刀丢落的地方叫吴刀，血流处为赤溪等村名，历经千年未变。

公元714年农历六月初一，吴媛上兴角山巅采药，时近晌午，坐在巨石上闭目养神，遂化蝶升天。百姓感其恩德，把其生前修道仙庐改建为馨角宫，塑像纪念，尊称吴妈、大妈、古妈、三妈（台湾）、慈感娘娘、太乙仙姑、吴氏圣妃、显圣天妃、法主仙妃、吴圣天妃等。自此，吴四娘成为百姓心目中的女神，香火不绝。

宋代道教兴盛，吴兴、吴媛兄妹治水有功，高宗绍兴十九年（公元1149年），兴化郡守陆奂钦奏请高宗皇帝敕封吴兴为义勇侯，吴媛为顺应夫人。宋淳佑二年（公元1242年），封吴媛为妙应灵济夫人，累封法主仙妃。至理宗淳佑五年（公元1245年），朝廷下旨褒扬吴氏一门治水开兴化北洋平原之先河有功，加封吴兴为“义勇普济侯”，妣叶氏为“昭惠夫人”，吴媛晋封为“吴圣天妃”。宋理宗钦赐“护国庇民”宝匾和两副对联：护国天妃功昭日月，庇民哲圣惠若乾坤；圣母显威灵震动满天星斗，天妃施神力共襄大地乾坤。明万历四十年，明神宗御赐“水为救民”宸翰一幅。